Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms