Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRB1P04280 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRB1P04280 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms