Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOC1P02654 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms