Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-HP01893 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms