Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV3-15P01624 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV3-15P01624 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV3-15P01624 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms