Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CBX6O95503 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CBX6O95503 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX6O95503 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms