Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SKAP2O75563 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms