Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHST1O43916 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHST1O43916 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHST1O43916 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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