Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CALUO43852 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CALUO43852 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CALUO43852 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CALUO43852 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CALUO43852 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms