Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF1O43189 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms