Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGSM2O43147 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms