Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASKO14936 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASKO14936 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASKO14936 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASKO14936 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms