Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APAF1O14727 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APAF1O14727 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APAF1O14727 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APAF1O14727 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms