Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9YO00507 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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