Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBXN8O00124 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms