Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL2C9JE40 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL2C9JE40 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms