Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLDN25C9JDP6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms