Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRBOX1C9JBD0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KRBOX1C9JBD0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms