Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-1B6SEH8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-1B6SEH8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms