Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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