Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPDC1A2A3K4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPDC1A2A3K4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms