Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms