Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR1DQ9Y2S0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR1DQ9Y2S0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms