Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP8A1Q9Y2Q0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms