Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCQ9Y266 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms