Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTPRQQ9UMZ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms