Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms