Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms