Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPUSD1Q9UJJ7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms