Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYTH4Q9UIA0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYTH4Q9UIA0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms