Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHORDC1Q9UHD1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms