Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DKK4Q9UBT3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms