Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DKK3Q9UBP4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms