Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNMT3BQ9UBC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms