Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT57Q9NWB7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms