Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMILIN3Q9NT22 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMILIN3Q9NT22 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms