Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS45Q9NRW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms