Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTN4Q9NQC3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTN4Q9NQC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms