Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LHX9Q9NQ69 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms