Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NLRC4Q9NPP4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms