Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms