Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms