Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMX4Q9H1E5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX4Q9H1E5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMX4Q9H1E5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms