Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NBPF3Q9H094 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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