Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA4CQ9C0C4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA4CQ9C0C4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms