Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM3Q9BZL3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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