Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms