Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCAPERQ9BY12 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms