Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SALL3Q9BXA9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SALL3Q9BXA9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms