Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLVAPQ9BX97 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLVAPQ9BX97 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms